苹果发布 SimpleDesign,可联合生成蛋白质序列与三维结构
苹果研究人员发布了蛋白质设计模型 SimpleDesign,相关论文以预印本形式刊登在 arXiv。该模型能够同时生成氨基酸序列和蛋白质三维结构,直接使用序列与连续三维坐标训练,无需先通过自编码器构建中间表示。模型使用超过 200 万组序列与结构配对数据进行训练,在蛋白质联合设计、结构生成和序列生成基准测试中取得了具有竞争力的结果。不过,目前这些结论仅来自计算机评估,尚未通过实验验证生成的蛋白质能否正确折叠、发挥功能,或在生物系统中安全运行。
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